Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Topbp1Q6ZQF0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms