Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ino80Q6ZPV2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms