Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl3Q6W5C0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms