Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn5Q6VZZ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms