Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rhox8Q6VSS7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Rhox8Q6VSS7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms