Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shc4Q6S5L9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms