Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja6Q6S5G4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms