Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nudcd1Q6PIP5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms