Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HjurpQ6PG16 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms