Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mfsd13aQ6PDE8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms