Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4aQ6PDC8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms