Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms