Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6PD19 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6PD19 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6PD19 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6PD19 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6PD19 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6PD19 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6PD19 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6PD19 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6PD19 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6PD19 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6PD19 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6PD19 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6PD19 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6PD19 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms