Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Herc4Q6PAV2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms