Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp49Q6P9L4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp49Q6P9L4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp49Q6P9L4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp49Q6P9L4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp49Q6P9L4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp49Q6P9L4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp49Q6P9L4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp49Q6P9L4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp49Q6P9L4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp49Q6P9L4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp49Q6P9L4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms