Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp2d40Q6P8N9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp2d40Q6P8N9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms