Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms