Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsd3Q6P2L6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsd3Q6P2L6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms