Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asic1Q6NXK8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asic1Q6NXK8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms