Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HelbQ6NVF4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms