Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms