Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg16l2Q6KAU8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms