Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep78Q6IRU7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep78Q6IRU7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep78Q6IRU7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep78Q6IRU7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep78Q6IRU7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep78Q6IRU7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep78Q6IRU7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep78Q6IRU7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep78Q6IRU7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep78Q6IRU7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms