Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CltbQ6IRU5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms