Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arhgap20Q6IFT4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms