Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms