Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop58Q6DFW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms