Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6DFW0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6DFW0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms