Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pram1Q6BCL1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Pram1Q6BCL1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pram1Q6BCL1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pram1Q6BCL1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pram1Q6BCL1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pram1Q6BCL1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pram1Q6BCL1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pram1Q6BCL1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pram1Q6BCL1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pram1Q6BCL1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pram1Q6BCL1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms