Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prex1Q69ZK0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prex1Q69ZK0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prex1Q69ZK0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prex1Q69ZK0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prex1Q69ZK0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prex1Q69ZK0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prex1Q69ZK0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms