Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk13Q69ZA1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk13Q69ZA1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk13Q69ZA1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk13Q69ZA1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk13Q69ZA1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk13Q69ZA1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk13Q69ZA1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk13Q69ZA1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk13Q69ZA1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk13Q69ZA1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk13Q69ZA1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms