Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp4Q68FH0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms