Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc8eQ66JT1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc8eQ66JT1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms