Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PtprdQ64487 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PtprdQ64487 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PtprdQ64487 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprdQ64487 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms