Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja3Q64448 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja3Q64448 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms