Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms