Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tm4sf1Q64302 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tm4sf1Q64302 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms