Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt12Q64291 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt12Q64291 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms