Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxa13Q62424 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxa13Q62424 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxa13Q62424 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxa13Q62424 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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