Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SypQ62277 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SypQ62277 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SypQ62277 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms