Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms