Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema4bQ62179 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4bQ62179 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms