Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms