Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3bQ62141 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms