Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkd1Q62101 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms