Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
OclnQ61146 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms