Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms