Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DbpQ60925 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DbpQ60925 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DbpQ60925 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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DbpQ60925 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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