Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms