Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot7Q60809 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot7Q60809 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms